大量砍伐原始森林改种玉米，导致巴西逐渐成为世界第四大温室气体排放国，随着生物燃料对粮食需求的增加，越来越多的森林在被破坏，这也与生物燃料借植物光合作用平衡燃烧排放二氧化碳的计划违背。另外，由于这些初级农作物是许多其他农业活动的原料，因此这些初级农作物的价格将会推高肉类、乳类和其他日常食品的价格。从生物能源的另外一个方面来说，生物能源挤占了粮食种植的资源，消耗了粮食收成，造成了大量的浪费，并破坏了土地资源。生物能源反而加重了粮食短缺的情况，加剧了贫困和饥饿。而今，世界银行、联合国粮农组织及国际货币基金组织更是一致认为，生物燃料行业需求的不断上升，是造成粮食价格上涨的重要原因。另一方面，油价上升还影响到农业生产，比如燃油的价格上涨就使得拖拉机等农具的使用费用加大，而用于生产某些种类化肥的天然气涨价也在一定程度上增加了农业生产成本。

　　在今后更长的一段时间，生物能源作物的种植是否扩大，取决于它是否能够获利，这就要取决于能源价格的高低——能源价格又以石油价格为晴雨表。根据调查研究，当石油价格为60到70美元的时候，生物能源的生产就能够带来利润。也就是说，只要石油价格高于这个门槛，生物能源生产就有扩大的趋势。

　　油价和粮价的上涨本来已经令人忧心忡忡，美国次贷危机的升级则无异于雪上加霜。由于金融市场趋于动荡，诱使大量投机资金流入农产品及原油期货交易市场，进一步加剧了粮价和油价的不稳定状况。从发展总体上看，生物能源将有利于发达国家，尤其是发达国家的农产品出口国，既缺少石油又缺少农业生产能力的发展中国家将是最大的受损者。发达国家之所以敢于以打破全球粮食供求均衡为代价大规模发展生物能源，这是和全球农产品的基本供求格局联系在一起的。多年来，发达国家的农业政策特征是以损害消费者的利益对农业生产者给予补贴。而发展中国家的农业政策特征则表现为以损害农业生产者的利益压低农产品的价格。

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